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• Ciências Fisiológicas (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Ciências Farmacêuticas (Câmpus de Araraquara)
  Faculdade de Odontologia (Câmpus de Araraquara)
  
• Ciências Odontológicas (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Odontologia (Câmpus de Araraquara)
  
• Ciências Sociais (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Filosofia e Ciências (Câmpus de Marília)
  
• Ciências Sociais (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Ciências e Letras (Câmpus de Araraquara)
  
• Ciências Veterinárias (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (Câmpus de Jaboticabal)
  
• Cirurgia e Medicina Translacional (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Medicina (Câmpus de Botucatu)
  
• Cirurgia Veterinária (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (Câmpus de Jaboticabal)
  
• Comunicação (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Arquitetura, Artes, Comunicação e Design (Câmpus de Bauru)
  
• Desastres Naturais (Mestrado e Doutorado)
  Instituto de Ciência e Tecnologia (Câmpus de São José dos Campos)
  
• Desenvolvimento Humano e Tecnologias (Mestrado e Doutorado)
  Instituto de Biociências (Câmpus de Rio Claro)