Ciência da Computação (Mestrado e Doutorado) Faculdade de Ciências
(Câmpus de Bauru) Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas
(Câmpus de São José do Rio Preto) Instituto de Geociências e Ciências Exatas
(Câmpus de Rio Claro) Faculdade de Ciências e Tecnologia
(Câmpus de Presidente Prudente)
Ciência e Tecnologia Animal (Mestrado) Faculdade de Engenharia
(Câmpus de Ilha Solteira) Faculdade de Ciências Agrárias e Tecnológicas
(Câmpus de Dracena)