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• Mídia e Tecnologia (Mestrado Profissional)
  Faculdade de Arquitetura, Artes, Comunicação e Design (Câmpus de Bauru)
  
• Multicêntrico em Ciências Fisiológicas (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Odontologia (Câmpus de Araçatuba)
  
• Música (Mestrado e Doutorado)
  Instituto de Artes (Câmpus de São Paulo)
  
• Nanotecnologia Farmacêutica (Doutorado)
  Faculdade de Ciências Farmacêuticas (Câmpus de Araraquara)
  
• Odontologia (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Odontologia (Câmpus de Araraquara)
  
• Odontologia (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Odontologia (Câmpus de Araçatuba)
  
• Odontologia (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Odontologia (Câmpus de Araraquara)
  
• Odontologia Restauradora (Mestrado e Doutorado)
  Instituto de Ciência e Tecnologia (Câmpus de São José dos Campos)
  
• Patologia (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Medicina (Câmpus de Botucatu)
  
• Pesquisa Clínica (Mestrado Profissional)
  Faculdade de Medicina (Câmpus de Botucatu)
  Centro de Estudos de Venenos e Animais Peçonhentos (Campus de Botucatu)