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• Engenharia Elétrica (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Engenharia (Câmpus de Bauru)
  
• Engenharia Mecânica (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Engenharia e Ciências (Câmpus de Guaratinguetá)
  
• Engenharia Mecânica (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Engenharia (Câmpus de Ilha Solteira)
  
• Engenharia Mecânica (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Engenharia (Câmpus de Bauru)
  
• Ensino de Física (Mestrado Profissional)
  Faculdade de Ciências e Tecnologia (Câmpus de Presidente Prudente)
  
• Ensino e Processos Formativos (Mestrado)
  Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (Câmpus de São José do Rio Preto)
  Faculdade de Engenharia (Câmpus de Ilha Solteira)
  Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (Câmpus de Jaboticabal)
  
• Estudos Linguísticos (Mestrado e Doutorado)
  Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (Câmpus de São José do Rio Preto)
  
• Estudos Literários (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Ciências e Letras (Câmpus de Araraquara)
  
• Farmacologia e Biotecnologia (Mestrado e Doutorado)
  Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (Câmpus de São José do Rio Preto)
  Instituto de Biociências (Câmpus de Botucatu)
  
• Filosofia (Mestrado)
  Faculdade de Filosofia e Ciências (Câmpus de Marília)