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• Agronomia (Produção Vegetal) (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (Câmpus de Jaboticabal)
  
• Agronomia (Proteção de Plantas) (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Ciências Agronômicas (Câmpus de Botucatu)
  
• Alimentos e Nutrição (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Ciências Farmacêuticas (Câmpus de Araraquara)
  
• Alimentos, Nutrição e Engenharia de Alimentos (Mestrado e Doutorado)
  Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (Câmpus de São José do Rio Preto)
  Faculdade de Ciências Farmacêuticas (Câmpus de Araraquara)
  
• Anestesiologia (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Medicina (Câmpus de Botucatu)
  
• Animais Selvagens (Mestrado e Doutorado)
  Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (Câmpus de Botucatu)
  
• Aquicultura (Mestrado e Doutorado)
  Centro de Aquicultura (Unidade Complementar - Jaboticabal)
  
• Arquitetura e Urbanismo (Mestrado)
  Faculdade de Arquitetura, Artes, Comunicação e Design (Câmpus de Bauru)
  
• Artes (Mestrado e Doutorado)
  Instituto de Artes (Câmpus de São Paulo)
  
• Artes (Mestrado Profissional)
  Instituto de Artes (Câmpus de São Paulo)